Trots att året 2020 som helhet blev rekordvarmt var ytvattentemperaturerna i juli förhållandevis låga. Den varma vintern gjorde dock avtryck i bottenvattentemperaturerna. Salthalten fortsätter öka längs Svealandskusten och fosforhalterna ligger kvar på en hög nivå. Förbättringar med minskande klorofyll och ökande siktdjup i Stockholms innerskärgård kan kopplas till minskad tillgång på kväve i motsvarande område.

År 2020 blev rekordvarmt i SMHIs mätningar. Årsmedeltemperaturen för Sverige blev den högsta som uppmätts sedan rikstäckande observationer inleddes omkring 1860. Efter en delvis rekordvarm juni följde en i allmänhet kylig eller mycket kylig juli innan värmen återkom med besked i början av augusti. Temperaturen i ytvattnet vid förbundets mätningar var lite kallare vatten än normalt i juli och något varmare än normalt i augusti, och sommaren som helhet förhållandevis normal.

Stora temperaturskillnader i skärgården
Temperaturvariationen mellan olika delar av skärgården är stor. Det kallaste vattnet hittar man ofta längst in i Saltsjön i Stockholm. Detta beror på att Mälarens utflöde driver en utåtgående ström vilket skapar en motriktad, det vill säga inåtgående, kall djupvattenström som kommer upp till ytan närmast Stockholm. I juli 2020 var temperaturen i Saltsjön 14–15 grader, ungefär samma som i ytterskärgården. Det varmaste vattnet återfinns i vissa skyddade vikar, som Värmdös inre vatten och de avsnörda vikarna väster om Nynäshamn. Här var det drygt 21 grader i ytan i augusti 2020. Djupvattnet i de stora fjärdarna var tydligt varmare 2020 än normalt. Det här har troligen med den varma vintern att göra, eftersom vattnet då normalt kyls ner kraftigt och blandas om ner till stora djup.